Ribointerferencia

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Fichier:Mechanism of RNA interference.jpg

Mécanisme de RNAi / ribointerferencia intervenu par siRNA.

La ribointerferencia ou RNAi (acrónimo du nom en anglais RNA interference) est un mécanisme de silenciamiento post-transcripcional de gènes spécifiques, exercé par des molécules d'ARN que, en étant complémentaires à un ARN messager, conduisent habituellement à la dégradation de celui-ci.

Doit se distinguer entrez :

Ribointerferencia (Ou interférence par ARN, RNAi), qu'est le mécanisme bio ou la technicienne expérimentale qu'il le profite de, et qu'il présente des variations en fonction du type de molécule d'ARN interferente concernée dans le procès.

ARN interferente (Ou ARN d'interférence; en anglais, interfering RNA), qu'est la molécule d'ARN qu'exerce ribointerferencia, et peut être de divers types (siRNA, miRNA ou piRNA).

Évolution

À partir d'études filogenéticos computacionales basés sur le principe de maximale parsimonia, le ancêtre commun plus récent de tous les eucariotas probablement déjà possédait une route primitiva de RNAi; il se pense que l'absence de la route en certains eucariotas est une caractéristique dérivée.^[1] Ce système de RNAi ancestral probablement contenait une protéine similaire à Dicer, une protéine Argonauta, une protéine PIWI, et une ARN polimerasa dépendante d'ARN (RdRP) que pourrait y avoir réalisé autres fonctions cellulaires. Une étude à grande échelle de genómica comparative aussi indique que le groupe couronne (un groupe monofilético vif, ou clado, que consiste du dernier ascendant commun de tous les exemplaires vifs, plus tous ses descendants) déjà possédait ces composants, qu'ils à ce moment-là pourraient y avoir des eues associations fonctionnelles plus étroites avec les systèmes généraux de dégradation de l'ARN comme le exosoma.^[2] Cette étude aussi suggère que la famille de protéines "Argonauta" d'union à ARN, qu'est commune entre les eucariotas, la plupart des Archaea, et au moins quelques bacterias (tels comme Aquifex aeolicus), est homologue et originalmente dérivée des composants du système d'initiation de la traduction.

Il se pense que la fonction ancestrale du système de RNAi est la défense immune contre des éléments génétiques exógenos tels comme transposones et genomas viraux.^[1]^[3] Quelques fonctions liées, comme la modification de histonas, pourraient y avoir état déjà présents dans l'ancêtre des modernes eucariotas, bien que semble qu'autres fonctions comme la régulation du développement par les miRNA seraient postérieurement apparu.^[1]

Les gènes de la ribointerferencia, comme des composants du système immun antiviral en beaucoup d'eucariotas, sont impliqués en une "bataille évolutive" avec les gènes viraux. Quelques virus ont développé des mécanismes pour supprimer la réponse de RNAi de ses cellules hôte, un effet très apparent surtout dans les virus de plantes.^[4] Études des taxes évolutives en Drosophila montrent que les gènes de la route de RNAi sont soumises une forte sélection direccional et sont entre les gènes avec une taxe de évolution plus rapide du genoma de Drosophila.^[5]

Quelques protozoos eucariotas tels comme Leishmania major et Trypanosoma cruzi manquent complètement de la route de RNAi.^[6]^[7] La plupart des composants aussi sont absents en quelques hongos, notablement dans l'organisme modèle Saccharomyces cerevisiae.^[8] Le fait de que quelques ascomicetos et basidiomicetos manquez de routes de RNAi indique que quelques protéines requises pour la ribointerferencia se sont perdu de forme indépendante en beaucoup de linajes d'hongos, vraisemblablement en raison de l'évolution d'une nouvelle route avec fonction similaire, ou à la faute d'avantage sélectif en certains nichos.^[9]